Первоначальное устройство пещерной церкви относится к глубокой древности. Уже в XVIII веке она была всеми забыта и сравнялась с землей. Духовник обители иеромонах Феодосий видел на том месте по ночам чудный свет, а два священника, Марк и Николай, слышали благоухание. По указанию столетнего старца Мафусаила в 1846 году на этом месте был обретен пещерный храм.