История Спасского кафедрального собора начинается в 1837 году, когда русский государь Николай I посетил Пятигорск в рамках инспекционной поездки по Кавказу. Император отдал распоряжение об устройстве в Пятигорске большой каменной церкви. Известный архитектор Константин Андреевич Тон, также бывавший в Пятигорске предложил к строительству ряд храмов в «русском стиле». В 1842 году проект строительства собора был одобрен, в этом же году был объявлен всероссийский сбор средств для строительства Пятигорского собора. В 1845 году была собрана сумма, требующаяся для начала строительства, однако возведение собора весьма затянулось по причине нехватки средств и нарушения технологии строительства. Строительство завершилось в 1867 году и 31 мая 1869 года епископ Кавказский и Черноморский Феофилакт (Губин) совершил освящение собора во имя Христа Спасителя, исцеляющего расслабленного при Силоамской купели.
С начала XX века собор становится кафедральным для архиерея Терской области. Перед революцией здесь находилась кафедра епископа Арсения, потом епископа Макария, а с первых дней советской власти и по 30-е годы – архиепископа Мефодия (Абрамкина), расстрелянного в пятигорской тюрьме в 1937 году.
По указу советского правительства в 1927 году богослужения в храме были прекращены, а в 1936 храм был взорван.
Решение о восстановлении собора было принято в начале 90-х гг. 1 августа 1992 года состоялось освящение места и установлен крест, где было положено начало восстановления собора Христа Спасителя, исцеляющего расслабленного у Овчей Купели. В 2005 году начались работы по восстановлению собора.
В 2011 году была воссоздана Пятигорская архиерейская кафедра. И восстановление собора, ставшего главным храмом Пятигорской и Черкесской, епархии ускорилось. Собор был освящён Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Кириллом 14 декабря 2012 года. Патриаршим указом, собор приобрёл статус кафедрального.