Родился в семье священника Григория Конобеевского. Фамилия Гумилевский ему была дана в семинарии всвязи с его малым ростом и смиренным нравом (от латинского humilis — низкий, незнатный). Существуютданные, что в юности Дмитрий посетил Саровскую пустынь, где Серафим Саровский сказал про него: «Сейотрок будет великим светильником Церкви и прославится по всей Руси, как учёный муж».
Окончил Шацкое духовное училище, Тамбовскую духовную семинарию, Московскую духовную академию (состепенью магистра, вторым в выпуске), по окончании которой был оставлен при ней для подготовки кпреподавательской деятельности. Доктор богословия (1860).
19 августа 1829 был пострижен в монашество. При пострижении митрополит Московский и КоломенскийФиларет (Дроздов) дал ему свое имя — беспрецедентный случай в истории академии.
С 3 февраля 1830 года — иеродиакон. С 29 июня 1830 года — иеромонах.
С 6 июня 1831 года — бакалавр по кафедре церковной истории Московской духовной академии, член собораиеромонахов московского Донского монастыря, цензор.
С 1832 года — профессор по кафедре Священного Писания.
С 1 мая 1833 года — инспектор Московской духовной академии, профессор по кафедре нравственного ипастырского богословия.
С 27 января 1835 года — архимандрит.
С 14 декабря 1835 года — ректор Московской духовной академии. Основал академический журнал«Творения святых Отцев в русском переводе с прибавлениями духовного содержания».
С 9 марта 1837 года, одновременно, настоятель московского Богоявленского монастыря.