Монастырь был основан св. блгв. кн. Даниилом Московским, сыном св. Александра Невского, на месте, ныне занимаемом Свято-Даниловым монастырём, вблизи Серпуховской заставы. Монастырь был перенесён вел. кн. Иоанном III на так называемый Васильевский стан на берегу Москвы-реки и получил название «Новоспасский». Особенно почитался российскими государями из династии Романовых как место погребения их предков. Настоятелями в разные периоды истории монастыря были: свт. Иов, первый Патриарх Московский и всея Руси, Патриарх Никон, Патриарх Питирим, свт. Филарет, митр. Московский и Коломенский и другие достойные иерархи и священнослужители РПЦ. Монастырь закрыли в 1918 г., В 1991 г. Новоспасский монастырь возвращён РПЦ.