Село Братцево известно с XVII в. С 1618 г хозяином Братцево является дьяк А. Иванов, затем с 1626 г. астраханский воевода А. Зубов. В 1657 г. владельцем имении становится боярин Б.М. Хитрово. При нем осуществляется крупное строительство. В 1672 году был построен усадебный каменный храм Покрова Пресвятой Богородицы и шатровой колокольней. Архитектура: бесстолпный двусветный четверик, увенчанный ярусами кокошников и пятью главами. С запада примыкают трапезная и колокольня, с востока — выдвинутая трехчастная апсида. Снаружи украшен каменным декором и цветными изразцами. С севера в 1887 г. был пристроен придел Алексия человека Божия, затем переименованный в Сретенский, позже — во имя свт. Иоанна Златоуста.
После Хитрово селом владели Нарышкины, затем Строгановы. При них выстроен новый усадебный ансамбль, по проекту зодчего А. Воронихина, бывшего крепостного. В 1840 г., при владельце Ладомирском, храм был реставрирован в стиле романтизма. Святыней храма почиталась чудотворная древняя икона «Одигитрия».
В 1922-23 г. изъяты церковные ценности. Храм закрыт в 1934 г. по инициативе рабочих фабрики «Прогресс», колокольня и купола разрушены, интерьер перестроен. В нем размещались фабрика красителей, склад и станция техобслуживания. В 1990 г. церковь возвращена верующим. Богослужения возобновлены в январе 1993 г. К 2000 г. проведены масштабные реставрационные работы.