В современном здании Московского Государственного Областного Университета с 1825 года размещалось общество трудолюбия, впоследствии ставшее Елизаветинским женским училищем, а затем Елизаветинским институтом благородных девиц.
В 1862 году к усадьбе было пристроено помещение домовой церкви Живоначальной Троицы.
В годы гонений Елизаветинский институт был закрыт, а церковь упразднена. С середины 20-х годов ХХ века в здании бывшей усадьбы размещался Московский областной педагогический институт, переименованный в Московский Государственный Областной Университет.
В 2003 году помещение храма было передано как приписное к приходу храма Покрова Пресвятой Богородицы в Красном Селе.
С 2003 года по настоящее время в храме ведутся реставрационно-восстановительные работы.