В 1947 году в городе Ишимбае была открыта деревянная церковь.По ходатайству настоятеля о. Сергея (Семёнова) и по благословению епископа Уфимского и Стерлитамакского Никона в 1993 г. в мае было освящено новое место под строительство храма. Первая служба в новом храме прошла на Пасху 2004 года. С 2003 по 2009 г. в храме велась внутренняя роспись и устанавливался иконостас. 19 августа 2009 года, в праздник Преображения Господня, состоялось освящение Свято-Троицкого храма г. Ишимбая. Освящение храма совершил Архиепископ Уфимский и Стерлитамакский Никон.