Приход храма святых мучеников Флора и Лавра в Коломенской Ямской слободе документально известен с 1625 года.
Современное здание трехпрестольного храма было построено в 1862 году. Архитектор неизвестен.
Главный престол освящен в честь иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость» с приделами во имя апостолов Петра и Павла и мучеников Флора и Лавра.
В годы гонений приход был снят с юридической регистрации, а храм закрыт и передан в народное хозяйство в конце 1930-х годов.
В 1991 году приход был возрождён и получил юридическую регистрацию. В том же году приходу было передано бывшее здание храма.