Вместе со строительством на Девичьем поле клиник Московского университета в 1890 году была поставлена часовня для отпевания умерших больных.
В 1903 году здание часовни переоборудовано в храм преподобного Димитрия Прилуцкого. Архитектор Б. Кожевников.
Храм был приписан к приходу храма Архистратига Михаила при клиниках на Девичьем поле.
В годы гонений здание храма было закрыто для богослужений и передано в народное хозяйство в 1930 году.
В 1990 году был образован приход храма, который получил юридическую регистрацию. В том же году приходу было передано бывшее здание храма.