Село Спас-Прогнань расположено на берегу небольшой реки Прогнани. Впервые село упоминается в 1613 г как вотчина Свято-Пафнутьева Боровского монастыря. В то время оно представляло собой погост с деревянным Храмом.
В 5 км. от погоста, на берегу реки Истья, находилось село Окатово — родовое имение выдающегося русского математика прошлого века, основоположника русской школы теории механизмов и машин Чебышева П.Л. С начала XVIII в. село входило в имение дворян Чебышевых. Дом и маленькое сельцо Окатово в 1941 году были сожжены фашистами. Могила Чебышева П.Л. и 2-х его младших братьев находиться в склепе под колокольней храма, у северной стены храма — могила родителей ученого. В 1784г. И.А.Золотухин построил в селе каменный Храм в честь Преображения Господня по проекту архитектора М.Г. Преображенского. Преображенская церковь с. Спас-Прогнань построена по традиционной схеме – отдельно стоящая колокольня, трапезная, четверик, апсида – вытянутой по оси запад–восток. В 1829г. его внук, математик П.Л. Чебышев, построил каменную колокольню. Храм, не уступающей по высоте колокольне выстроен по типу «восьмерик на четверике». Обилие света в храме обеспечено наличием окон 2-го света и тремя большими проёмами восьмерика. Апсида – 2-х частная, трапезная перекрыта системой сводов на 2-х столбах. Декоративное убранство значительно сохранило черты барокко: рустованые угловые пилястры имеют утройную креповку, белокаменные карнизы четверика и восьмерика – сложный профиль, наличники окон с лучковой перемычкой, сандриками треугольной или лучковой формы, белокаменными замками и т.п. Фрис алтарной апсиды и южной стены трапезной сохранил поребрик – деталь более архаичную. Все декоративные элементы выполнены из кирпича и оштукатурены. Сохранились железные двери, решетки в окнах «купчатой» формы и поздние (19 век) козырьки над входами перерезавшие обрамления. Кровля железная. Храм имел четыре Престола: главный – в честь Преображения Господня и пределы – в честь Благовещения Пресвятой Богородицы, в честь великомученика Георгия Победоносца и в честь преподобного Пафнутия Боровского, устроенный в колокольне. В XX веке Храм не закрывался. 8 декабря 1937 года был репрессирован священник Храма Григорий Васильевич Виноградов. С 1948 г. в колокольне был устроен музей П.Л.Чебышева, и до 90-х годов она была в ведении государства. С 1942г., в течение 36 лет, настоятелем Храма был схиархимандрит Амвросий (Иванов), похороненный рядом с Храмом. С 11 сентября 1996 г. настоятелем Храма является иеромонах Никифор (Коженков). Со второй половины 90-х годов в Храме ведутся ремонтные работы. В Храме сохранились барочные иконостасы XVII в. В 1996 году были произведены первые работы по восстановлению Храма. Обновлена колокольня и установлены колокола. В 1997 году обновлены наружная часть Храма, а с 1999 года началась роспись Храма. В 2001 году усилиями Московской Академии Наук была произведена работа по реставрации родового склепа Чебышевых.